24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2501 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  100 
 
 		 569 aa  1170    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1291  glycoside hydrolase family protein  54.68 
 
 		 554 aa  593  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186796  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  35.25 
 
 		 925 aa  283  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2959  glycoside hydrolase family 42 protein  35.73 
 
 		 571 aa  280  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  34.47 
 
 		 534 aa  267  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1339  hypothetical protein  33.76 
 
 		 571 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.946063  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3530  glycoside hydrolase family 35  32.97 
 
 		 546 aa  227  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0694576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  37.33 
 
 		 534 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  35.04 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  27.65 
 
 		 780 aa  60.5  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  23.78 
 
 		 610 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  24.88 
 
 		 598 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  24.11 
 
 		 612 aa  47.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  25.78 
 
 		 612 aa  47  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  22.49 
 
 		 686 aa  47  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  25.12 
 
 		 586 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  25.95 
 
 		 580 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  27.86 
 
 		 613 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  23.21 
 
 		 586 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  25.75 
 
 		 609 aa  44.3  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  24.05 
 
 		 649 aa  44.3  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  23.66 
 
 		 584 aa  43.9  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  22.66 
 
 		 679 aa  43.9  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  26.58 
 
 		 701 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>