193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1514 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  100 
 
 
231 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  52.31 
 
 
221 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  52.31 
 
 
221 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  51.85 
 
 
221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  53.08 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  49.32 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  50.93 
 
 
221 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  49.77 
 
 
223 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  49.32 
 
 
223 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  48.87 
 
 
226 aa  224  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  50.23 
 
 
234 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  50 
 
 
223 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  47.91 
 
 
223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  49.54 
 
 
223 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  49.07 
 
 
223 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  45.74 
 
 
229 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  47.57 
 
 
223 aa  215  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  49.03 
 
 
220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  46.7 
 
 
224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  48.82 
 
 
223 aa  214  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  50.74 
 
 
223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  46.8 
 
 
236 aa  211  7e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  46.31 
 
 
222 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  48.33 
 
 
226 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  48.31 
 
 
220 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  46.95 
 
 
223 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  47.17 
 
 
221 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  51.23 
 
 
221 aa  202  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4182  carboxylesterase  48.36 
 
 
223 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  44.39 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  46.01 
 
 
227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  47.09 
 
 
248 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  45.63 
 
 
220 aa  198  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  45.02 
 
 
222 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3288  carboxylesterase  45.19 
 
 
222 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  42.27 
 
 
226 aa  194  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  46.53 
 
 
223 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  47.24 
 
 
221 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  44.88 
 
 
231 aa  191  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  43.06 
 
 
226 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4297  carboxylesterase  44.6 
 
 
232 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  45.73 
 
 
225 aa  185  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  45.1 
 
 
219 aa  185  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  41.83 
 
 
222 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  42.58 
 
 
226 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  41.26 
 
 
233 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  47.06 
 
 
218 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  42.86 
 
 
222 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  41.95 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  41.95 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  41.95 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  41.95 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  41.95 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  41.95 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  41.06 
 
 
222 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  41.58 
 
 
250 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  40.49 
 
 
319 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  40.1 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  42.58 
 
 
224 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  47.29 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1846  carboxylesterase  37.44 
 
 
225 aa  170  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  41.63 
 
 
224 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  44.81 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  37.38 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  41.06 
 
 
218 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  41.55 
 
 
218 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  43.56 
 
 
219 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  41.55 
 
 
218 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  43.6 
 
 
219 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  40.58 
 
 
218 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  42.36 
 
 
215 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0434  hypothetical protein  39.81 
 
 
219 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0410  hypothetical protein  39.81 
 
 
219 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  40.59 
 
 
215 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0035  carboxylesterase  37.44 
 
 
221 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  34.34 
 
 
229 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02430  acyl-protein thioesterase-1, putative  35.32 
 
 
238 aa  135  7.000000000000001e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32853  predicted protein  35.85 
 
 
226 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  36.76 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08748  Acyl-protein thioesterase 1 (EC 3.1.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASI2]  38.53 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83761  predicted protein  33.62 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199859  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2587  phospholipase/carboxylesterase  50.44 
 
 
124 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000792011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  33.82 
 
 
218 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  34.01 
 
 
193 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2584  phospholipase/carboxylesterase family protein  47 
 
 
101 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  33 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  32.32 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  32.32 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33720  predicted protein  31.91 
 
 
260 aa  95.5  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  33.68 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  30.3 
 
 
230 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  31.44 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  34.22 
 
 
212 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  26.5 
 
 
223 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  28.97 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  28.1 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  28 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  28.12 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  26.73 
 
 
222 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  28.12 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>