46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1467 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  33.86 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1085  Rhomboid family protein  32.14 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1915  rhomboid family protein  27.46 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2165  rhomboid family protein  32.71 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1093  Rhomboid family protein  30.99 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  28.49 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  31.78 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  29.73 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2504  hypothetical protein  31.78 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  32.86 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  34.04 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  25.67 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  30.32 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  30.32 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  34.04 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  34.02 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  30.32 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  30.32 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  29.68 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2160  rhomboid family protein  28.04 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  28.97 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  30.92 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  28.97 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4990  peptidase S54-type, rhomboid-like protein  32.53 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25145  normal  0.208438 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  28.97 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1853  rhomboid family protein  25.44 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  28.97 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01423  hypothetical protein  29.58 
 
 		 162 aa  48.5  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0800  rhomboid family protein  29.91 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  28 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2016  rhomboid-like protein  25.31 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  29.84 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  31.43 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004038  membrane protein  26.38 
 
 		 183 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03896  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  26.36 
 
 		 289 aa  45.4  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  31.91 
 
 		 519 aa  45.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  27.96 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  28.16 
 
 		 513 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2655  hypothetical protein  34.04 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0995  hypothetical protein  33.68 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0244119  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  25.27 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  38.98 
 
 		 291 aa  43.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  28.57 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 223 aa  42  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  25 
 
 		 194 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>