More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1309 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1309  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 128 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 124 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 128 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 128 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 126 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 137 aa  85.9  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 127 aa  85.9  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 126 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  35.29 
 
 		 128 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  36.52 
 
 		 131 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 127 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  35.34 
 
 		 124 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  37.29 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  37.29 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  34.78 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 131 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  31.91 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 127 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 132 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 131 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 127 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  35.65 
 
 		 127 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  35.59 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  34.15 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  34.17 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  33.61 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  33.61 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  33.61 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  34.78 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  35.34 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 129 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  32.54 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 126 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  32.77 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  37.97 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  32.77 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  34.19 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  32.52 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  41.89 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  43.24 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  43.24 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  32 
 
 		 294 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1326 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  33.58 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  32 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  31.62 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  31.62 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  32.48 
 
 		 131 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 127 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  32 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 123 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 123 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  31.62 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  31.62 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  31.62 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  31.9 
 
 		 129 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>