100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1150 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  100 
 
 		 178 aa  360  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  42.29 
 
 		 172 aa  144  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  39.08 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  40.35 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  40.7 
 
 		 180 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  39.31 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  38.73 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.51 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.29 
 
 		 173 aa  127  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  38.29 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  37.93 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  36.47 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.86 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.29 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.99 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  35.63 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.72 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  32.94 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  36.05 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.32 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  33.91 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  29.07 
 
 		 385 aa  87.8  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1407  ACT domain-containing protein  32.94 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.222833  normal  0.039362 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.36 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  33.14 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.14 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.16 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  32.57 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.94 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2735  ACT domain-containing protein  32.57 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.37 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2819  amino acid-binding ACT domain protein  34.51 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1565  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.51 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1532  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.51 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0236669  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1537  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.51 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1722  ACT domain-containing protein  32.95 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2585  amino acid-binding ACT  29.17 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.77 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.07 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.59 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.32 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  26.86 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  25.29 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.43 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.28 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2884  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  27.89 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3434  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  26.19 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  26.55 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0665  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  24.56 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2546  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3629  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  22.22 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.29 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  24.28 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.58 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  24.43 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.65 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  23.86 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  23.86 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  23.56 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.57 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.86 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  26.55 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.03 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51280  hypothetical protein  21.51 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1662  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  21.05 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3623  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  23.29 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2668  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.47 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000549184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2553  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.47 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000108497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1701  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  21.47 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0560544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1791  amino acid-binding ACT domain protein  21.47 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000108735  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3675  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  21.84 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  23.86 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4388  hypothetical protein  21.51 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  23.3 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  23.3 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2413  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.9 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204037  hitchhiker  0.00509125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1878  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.9 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3954  hypothetical protein  21.18 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  26.21 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02738  hypothetical protein  22.29 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2341  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.9 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1547  glycine cleavage system transcriptional repressor  21.97 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  24.72 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1655  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.9 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1370  glycine cleavage system transcriptional repressor  21.05 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.01 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  19.55 
 
 		 1319 aa  45.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  39.29 
 
 		 288 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  26.58 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  24.29 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35350  Transcriptional repressor glycine cleavage system-like protein  25.19 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.14 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  21.91 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  21.26 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.42 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  21.54 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  29.11 
 
 		 90 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  21.54 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003104  glycine cleavage system regulatory protein  21.94 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00303201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>