20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0865 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0865  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  986    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.417049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  32.54 
 
 		 580 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  33.45 
 
 		 634 aa  116  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  29.79 
 
 		 648 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  35.54 
 
 		 648 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  29.32 
 
 		 650 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 708 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 827 aa  86.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 762 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 812 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 792 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 638 aa  54.3  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 570 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  25.08 
 
 		 540 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.45 
 
 		 653 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.45 
 
 		 654 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 639 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 616 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>