49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3890 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  98.84 
 
 
346 aa  711    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  99.13 
 
 
346 aa  713    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  99.42 
 
 
346 aa  714    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  86.99 
 
 
346 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  86.42 
 
 
346 aa  627  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  86.42 
 
 
346 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  85.84 
 
 
346 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  86.99 
 
 
346 aa  620  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  70.72 
 
 
349 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  69.65 
 
 
346 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  68.01 
 
 
351 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  68.21 
 
 
350 aa  498  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  66.47 
 
 
350 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  64.35 
 
 
351 aa  477  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  48.4 
 
 
362 aa  359  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  49.57 
 
 
358 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  48.71 
 
 
360 aa  339  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  51.17 
 
 
348 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  49.42 
 
 
348 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  47.93 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  47.35 
 
 
354 aa  306  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  42.65 
 
 
366 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  41.64 
 
 
347 aa  282  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  40.87 
 
 
343 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  40.06 
 
 
347 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  40.82 
 
 
345 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  39.36 
 
 
343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  38.64 
 
 
343 aa  259  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  38.82 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  38.44 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  33.33 
 
 
346 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  34.04 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  29.07 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.85 
 
 
377 aa  92.8  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  29.13 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  23.88 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  25.3 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  25.9 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  26.02 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  23.55 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  25.62 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  26.21 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  25 
 
 
367 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  25.91 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  24.92 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  22.81 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  22.42 
 
 
382 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  24.04 
 
 
381 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>