57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1200 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  100 
 
 		 315 aa  637    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  26.05 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  23.08 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  24.01 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  24.37 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  26.54 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  24.59 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  25.24 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  23.53 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  24.34 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  24.01 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  26.16 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  26.16 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  24.6 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  24.6 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  24.6 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  24.6 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  24.6 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  24.6 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  24.6 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  24.6 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  25.47 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  25.47 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  25.55 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  24.21 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  24.21 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  24.21 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  24.21 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  24.43 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  24.43 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  24.43 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  21.89 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  23.08 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  23.08 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.17 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  24.44 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  24.22 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  26.73 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  21.93 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  21.93 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  21.93 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.11 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.42 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  19.54 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  22.79 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  24.02 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  23.44 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  25 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>