117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2548 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  45.95 
 
 
258 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  45.1 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  42.69 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  41.92 
 
 
259 aa  215  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  43.97 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  41 
 
 
293 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  41.54 
 
 
255 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  39.3 
 
 
299 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  38.76 
 
 
309 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  37.4 
 
 
252 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.4 
 
 
304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  41.39 
 
 
244 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  35.69 
 
 
250 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  38.52 
 
 
257 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  33.6 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  28.46 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  26.98 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  27.73 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  24.62 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  27.45 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.59 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  26.59 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  27 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.69 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  27.53 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  26.18 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.4 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.81 
 
 
380 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.31 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  26.46 
 
 
358 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  22.66 
 
 
367 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  24.89 
 
 
335 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  23.88 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 
324 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  24.18 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  28.49 
 
 
423 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.34 
 
 
362 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  27.81 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.69 
 
 
590 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  24.23 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  27.64 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  27.96 
 
 
324 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  27.96 
 
 
324 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  27.96 
 
 
324 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  22.64 
 
 
377 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  26.88 
 
 
324 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  27.42 
 
 
324 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  25 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  22.26 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  29.02 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  24.24 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  21.85 
 
 
388 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  22.86 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  26.34 
 
 
324 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  24.2 
 
 
372 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  24.2 
 
 
372 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  24.28 
 
 
307 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  27.5 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  21.89 
 
 
360 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  26.32 
 
 
372 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.93 
 
 
385 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  21.74 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  21.81 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  21.83 
 
 
386 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  22.89 
 
 
377 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.9 
 
 
367 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.27 
 
 
469 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  24.62 
 
 
324 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  22.28 
 
 
296 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  24.1 
 
 
324 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0982  beta-lactamase domain protein  32.1 
 
 
308 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0208457  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  24.08 
 
 
350 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 
237 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  21.19 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  21.19 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  24.22 
 
 
353 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  30.72 
 
 
366 aa  45.4  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  23.66 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.78 
 
 
364 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  23.62 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  25.38 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  20.94 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.16 
 
 
368 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  20.82 
 
 
320 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  23.08 
 
 
362 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0584  hypothetical protein  35.8 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  28.48 
 
 
354 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  25.56 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  21.74 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  22.63 
 
 
403 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  21.86 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  23.68 
 
 
440 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>