21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2736 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  100 
 
 
756 aa  1486    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  35 
 
 
671 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  36.31 
 
 
762 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  29.56 
 
 
715 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  41.9 
 
 
824 aa  100  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  29.44 
 
 
540 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  24.53 
 
 
925 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1646  hypothetical protein  28.17 
 
 
623 aa  67.4  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327516  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  29.03 
 
 
600 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3494  hypothetical protein  27.78 
 
 
852 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0571399  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  26.8 
 
 
669 aa  61.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  26.78 
 
 
811 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  27.92 
 
 
828 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  33.74 
 
 
629 aa  55.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  33.74 
 
 
629 aa  55.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  33.74 
 
 
629 aa  55.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3052  putative membrane protein, phage K related  32.94 
 
 
574 aa  53.9  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00556585  hitchhiker  0.0000266051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  24.73 
 
 
794 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  26.62 
 
 
781 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  25.93 
 
 
820 aa  44.3  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  22.03 
 
 
853 aa  44.3  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>