45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4420 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4420  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204685  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4038  hypothetical protein  70.69 
 
 		 331 aa  329  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  35.92 
 
 		 242 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  45.83 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  45.83 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  45.24 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  42.11 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  40 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  44.95 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  44.04 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  39.08 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  41.96 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  42.42 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  44.79 
 
 		 262 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  35.11 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  44.04 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  35.71 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  46.15 
 
 		 243 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  37.63 
 
 		 258 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  29.48 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  36.51 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 448 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  35.79 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  30.26 
 
 		 326 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 325 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  32.04 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  32.04 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  42.99 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  32.04 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  32.04 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  32.04 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  32.04 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  41.84 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  27.69 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  30 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  23.36 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>