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for query gene Sama_3307 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3307  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 381 aa  745    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.635246  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000423  multidrug resistance protein D  59.95 
 
 		 378 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.575568  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0963  multidrug resistance protein D  59.89 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0211536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3551  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  56.91 
 
 		 379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3276  multidrug resistance protein D  55.28 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3485  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  49.06 
 
 		 382 aa  326  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_1082  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.71 
 
 		 389 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3171  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.98 
 
 		 387 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.44 
 
 		 387 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.44 
 
 		 387 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04859  hypothetical protein  44.8 
 
 		 434 aa  301  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.52 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.65 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0579  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.31 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1082  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.6 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2693  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.693922  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.44 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.44 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.59 
 
 		 399 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.31 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.98 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.88 
 
 		 399 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  37.29 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.49 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.88 
 
 		 399 aa  185  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154906  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_4263  MFS family transporter  37.04 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0514386  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_50050  MFS family transporter  36.31 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.012942 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.38 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.45 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.45 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3477  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.17 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.47 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.38 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.49 
 
 		 405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 		 434 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.98 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.2 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.87 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.81 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.23 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 405 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.95 
 
 		 424 aa  109  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.01 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.34 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.71 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.18 
 
 		 469 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  26.65 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  29.78 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  29.49 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.49 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 415 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 415 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.12 
 
 		 412 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 415 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.99 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.18 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.38 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.89 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.22 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  28.61 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 411 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 411 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.88 
 
 		 412 aa  99.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 411 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.8 
 
 		 425 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  25.5 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.36 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  28.14 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.4 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.41 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.9 
 
 		 452 aa  96.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  26.69 
 
 		 426 aa  96.3  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.44 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.22 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.22 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  25.07 
 
 		 398 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.8 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.55 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.78 
 
 		 408 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.68 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  30.86 
 
 		 386 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.51 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2581  membrane transport protein  27.13 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324578  normal  0.102072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  27.43 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  30.86 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  26.52 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.42 
 
 		 420 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  27.98 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.65 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  27.23 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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