More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1858 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.18 
 
 
278 aa  218  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1938  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.96 
 
 
338 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.8 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1883  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.52 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2321  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.25 
 
 
306 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.58316  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.35 
 
 
303 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2437  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.25 
 
 
306 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164708  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2590  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.76 
 
 
264 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2443  thiF protein, putative  44.44 
 
 
300 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2024  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.42 
 
 
309 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.83 
 
 
303 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2199  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.62 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1772  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.94 
 
 
302 aa  198  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  42.45 
 
 
245 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
249 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2015  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  44.76 
 
 
292 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  39.76 
 
 
249 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  41.13 
 
 
250 aa  185  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  41.34 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.68 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.98 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  42.51 
 
 
248 aa  182  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  40.98 
 
 
252 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.57 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  40.57 
 
 
252 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  43.2 
 
 
251 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.2 
 
 
251 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4405  adenylyltransferase ThiF  40.49 
 
 
252 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2094  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.23 
 
 
282 aa  175  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.15 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.13 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.84 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.7 
 
 
259 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.34 
 
 
253 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3872  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.08 
 
 
249 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.71 
 
 
251 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.73 
 
 
254 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  40.56 
 
 
252 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.08 
 
 
248 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.78 
 
 
251 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.96 
 
 
251 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.73 
 
 
266 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.16 
 
 
252 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3855  adenylyltransferase ThiF  39.92 
 
 
265 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0345  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.92 
 
 
265 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  39.29 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0453  thiamine biosynthesis protein ThiF  39.53 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000699536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.17 
 
 
252 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0034  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439342  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  40.16 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.73 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  38.52 
 
 
257 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.15 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.15 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.87 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.15 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  38 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.15 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.15 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.15 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.55 
 
 
252 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.71 
 
 
250 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.24 
 
 
266 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.55 
 
 
274 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3943  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.85 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910136  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1499  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.39 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039426  normal  0.0112948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 
266 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3793  molybdopterin biosynthesis protein  42.91 
 
 
271 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.62 
 
 
269 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.06 
 
 
250 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 
250 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.46 
 
 
250 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 
250 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  37.93 
 
 
258 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
259 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.886192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.02 
 
 
250 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.04 
 
 
480 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  40.16 
 
 
251 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.16 
 
 
251 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.16 
 
 
251 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.57 
 
 
251 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.16 
 
 
251 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  40.16 
 
 
251 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.43 
 
 
253 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.16 
 
 
251 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.02 
 
 
250 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.08 
 
 
251 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  37.1 
 
 
345 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  37.25 
 
 
264 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  38.13 
 
 
253 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4454  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.04 
 
 
251 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.74 
 
 
252 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.37 
 
 
251 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.68 
 
 
250 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.1 
 
 
251 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.56 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.16 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.75 
 
 
246 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>