More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1544 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 231 aa  248  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2802  ABC transporter related  56.54 
 
 		 225 aa  245  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1748  ABC transporter related  52.47 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00373907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  54.13 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1898  ABC transporter related  51.4 
 
 		 236 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1769  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0632527  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2744  ABC transporter related  52.53 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.600258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2484  ABC transporter related  47.47 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1497  ABC transporter related  44.91 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1447  ABC transporter related  42.72 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3493  ABC transporter related  42.66 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  35.96 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  36.13 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07291  putative phosphonate ABC transporter  30.04 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0104  ATPase  30.47 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.26 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.27 
 
 		 269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 		 307 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.38 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1293  ATPase  36.61 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  34.84 
 
 		 275 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 307 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 307 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 307 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 307 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  34.44 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1184  ATPase  35.87 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.795417  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  33.33 
 
 		 301 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.33 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  35 
 
 		 499 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  33.75 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  32.34 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.3 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.88 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  29.17 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.27 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  34.58 
 
 		 498 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.82 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  36.21 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  32.07 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  33.47 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  31.91 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  33.47 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.4 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  31.8 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  34.17 
 
 		 498 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  31.8 
 
 		 267 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  29.44 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  34.2 
 
 		 507 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4623  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.13 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02560  ABC transporter  33.05 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.15 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  32.19 
 
 		 265 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  29.44 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.06 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.21 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07451  putative phosphonate ABC transporter  30.29 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.42 
 
 		 277 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  31.6 
 
 		 275 aa  99  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  29.84 
 
 		 275 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.21 
 
 		 286 aa  99  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07251  putative phosphonate ABC transporter  28.86 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.74 
 
 		 264 aa  98.2  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.2 
 
 		 273 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  34.1 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 		 275 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  30.2 
 
 		 278 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.49 
 
 		 269 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.74 
 
 		 288 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.11 
 
 		 282 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  33.33 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3919  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.22 
 
 		 284 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  31.8 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  33.33 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  29.8 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3694  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  32.23 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.15 
 
 		 279 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.15 
 
 		 281 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.15 
 
 		 279 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.01 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  31.39 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  30.9 
 
 		 265 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  32.02 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.49 
 
 		 284 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3234  phosphonate ABC transporter ATP-binding  29.02 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  30.2 
 
 		 272 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11301  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  32.65 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0500512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.82 
 
 		 278 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.25 
 
 		 277 aa  92.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.02 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1683  ABC transporter related protein  30.38 
 
 		 269 aa  92.4  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0437  ABC transporter related protein  33.48 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  30.71 
 
 		 277 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>