More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1176 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1176  DMSO reductase family type II enzyme, iron-sulfur subunit  100 
 
 		 382 aa  799    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129403  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1336  DMSO reductase family type II enzyme, iron-sulfur subunit  58.01 
 
 		 373 aa  408  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2469  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  56.93 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00523376  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0025  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  56.46 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2583  respiratory nitrate reductase beta subunit  53.25 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68171  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.66 
 
 		 389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1902  4Fe-4S ferredoxin  46.01 
 
 		 317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0498  nitrate reductase, beta subunit  40.4 
 
 		 473 aa  277  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.43114  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1906  respiratory nitrate reductase beta subunit  40.15 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0508  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.84 
 
 		 549 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.408187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.26 
 
 		 584 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  35.91 
 
 		 519 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4428  nitrate reductase, beta subunit  35.06 
 
 		 588 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  36 
 
 		 543 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2420  nitrate reductase, beta subunit  35.28 
 
 		 519 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2468  nitrate reductase, beta subunit  35.28 
 
 		 519 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  34.55 
 
 		 491 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1986  respiratory nitrate reductase, beta subunit  37.29 
 
 		 517 aa  259  6e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  33.12 
 
 		 491 aa  259  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3447  nitrate reductase, beta subunit  34.74 
 
 		 513 aa  258  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.338628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  31.83 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  32.69 
 
 		 491 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1762  nitrate reductase, beta subunit  35.21 
 
 		 566 aa  257  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00378807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1583  nitrate reductase 2, beta subunit  35.85 
 
 		 514 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3700  nitrate reductase, beta subunit  35.98 
 
 		 554 aa  256  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5442  nitrate reductase (beta subunit)  34.16 
 
 		 553 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3289  nitrate reductase, beta subunit  34.43 
 
 		 513 aa  255  7e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0366444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  36.59 
 
 		 514 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01437  hypothetical protein  36.59 
 
 		 514 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.9 
 
 		 538 aa  255  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  36.59 
 
 		 514 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  32.47 
 
 		 491 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0776  nitrate reductase, beta subunit  34.19 
 
 		 513 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18710  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.48 
 
 		 544 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0498038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2077  nitrate reductase 2, beta subunit  36.59 
 
 		 514 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1551  nitrate reductase, beta subunit  36.59 
 
 		 514 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1707  nitrate reductase 2, beta subunit  36.59 
 
 		 514 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.764488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  36.34 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1648  nitrate reductase, beta subunit  36.59 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2189  nitrate reductase, beta subunit  36.59 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  36.1 
 
 		 514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1756  nitrate reductase 2 subunit beta  35.85 
 
 		 514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1764  nitrate reductase 2 subunit beta  35.85 
 
 		 514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.939627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  36.36 
 
 		 513 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  34.79 
 
 		 489 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  36.36 
 
 		 513 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1236  nitrate reductase, beta subunit  35.36 
 
 		 507 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.222412 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3085  nitrate reductase, beta subunit  36.19 
 
 		 525 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.74 
 
 		 511 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0965  nitrate reductase, beta subunit  34.19 
 
 		 513 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.68 
 
 		 512 aa  251  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  34.2 
 
 		 517 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5212  nitrate reductase subunit beta  34.43 
 
 		 560 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  0.717062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4545  nitrate reductase, beta subunit  35.38 
 
 		 550 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  35.37 
 
 		 515 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2157  nitrate reductase, beta subunit  34.67 
 
 		 550 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  35.98 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1262  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.61 
 
 		 551 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1288  nitrate reductase, beta subunit  35.61 
 
 		 551 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1279  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.61 
 
 		 551 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.319698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1825  nitrate reductase, beta subunit  33.33 
 
 		 559 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1854  nitrate reductase, beta subunit  34.96 
 
 		 520 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5003  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.15 
 
 		 515 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3139  nitrate reductase, beta subunit  36.13 
 
 		 576 aa  248  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250265  hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11187  respiratory nitrate reductase beta subunit narH  37.63 
 
 		 558 aa  248  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0337  Selenate reductase  41.72 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.963468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1404  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.81 
 
 		 522 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314304  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0204  nitrate reductase, beta subunit  36.7 
 
 		 483 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1021  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.61 
 
 		 495 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0219724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2039  nitrate reductase, beta subunit  35.36 
 
 		 511 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  33.55 
 
 		 512 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1772  nitrate reductase, beta subunit  35.94 
 
 		 520 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2804  nitrate reductase, beta subunit  34.12 
 
 		 558 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.477441  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  35.37 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1778  nitrate reductase, beta subunit  35.78 
 
 		 489 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1707  nitrate reductase, beta subunit  35.78 
 
 		 489 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  35.37 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  36.7 
 
 		 507 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0330  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.88 
 
 		 484 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000947818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2171  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.02 
 
 		 489 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2227  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.17 
 
 		 512 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.414586  normal  0.0461834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2303  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.17 
 
 		 512 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.932469  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0315  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.34 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0178  nitrate reductase, beta subunit  35.01 
 
 		 539 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  36.86 
 
 		 508 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2063  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.85 
 
 		 514 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1955  respiratory nitrate reductase beta subuni  33.55 
 
 		 512 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.089713 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0249  nitrate reductase, beta subunit  35.27 
 
 		 502 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0794164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1002  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.54 
 
 		 527 aa  246  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4477  nitrate reductase, beta subunit  36.68 
 
 		 526 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.619422  normal  0.432155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2127  nitrate reductase, beta subunit  35.28 
 
 		 509 aa  245  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3674  nitrate reductase, beta subunit  35.97 
 
 		 561 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364422  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.3 
 
 		 510 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1393  nitrate reductase 1, beta subunit  35.44 
 
 		 512 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2892  nitrate reductase, beta subunit  37.1 
 
 		 512 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161802  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01203  nitrate reductase 1, beta (Fe-S) subunit  35.44 
 
 		 512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.714292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2420  nitrate reductase, beta subunit  35.44 
 
 		 512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0556426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1709  nitrate reductase 1, beta subunit  35.44 
 
 		 512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0253644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1853  nitrate reductase, beta subunit  35.12 
 
 		 517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1335  nitrate reductase, beta subunit  35.44 
 
 		 512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00571547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>