More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0025 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0025  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  100 
 
 		 349 aa  722    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380385  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2469  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  76.09 
 
 		 358 aa  568  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00523376  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1336  DMSO reductase family type II enzyme, iron-sulfur subunit  74.49 
 
 		 373 aa  535  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1176  DMSO reductase family type II enzyme, iron-sulfur subunit  56.46 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.9 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2583  respiratory nitrate reductase beta subunit  48.5 
 
 		 333 aa  349  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68171  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1902  4Fe-4S ferredoxin  46.91 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0498  nitrate reductase, beta subunit  39.18 
 
 		 473 aa  279  6e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.43114  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1906  respiratory nitrate reductase beta subunit  39.18 
 
 		 473 aa  277  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4428  nitrate reductase, beta subunit  38.76 
 
 		 588 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.78 
 
 		 584 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  37.12 
 
 		 543 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3139  nitrate reductase, beta subunit  37.35 
 
 		 576 aa  265  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250265  hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5442  nitrate reductase (beta subunit)  37.59 
 
 		 553 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  37.78 
 
 		 508 aa  261  8.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2892  nitrate reductase, beta subunit  35.25 
 
 		 512 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.54 
 
 		 538 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  36.26 
 
 		 519 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0121  nitrate reductase, beta subunit  35.25 
 
 		 509 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18710  respiratory nitrate reductase beta subunit  37.25 
 
 		 544 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0498038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1629  nitrate reductase, beta subunit  35.25 
 
 		 509 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  36.68 
 
 		 491 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.86 
 
 		 512 aa  259  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1544  nitrate reductase, beta subunit  35.25 
 
 		 509 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  36.68 
 
 		 491 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3085  nitrate reductase, beta subunit  36.27 
 
 		 525 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  36.68 
 
 		 491 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2157  nitrate reductase, beta subunit  37.17 
 
 		 550 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0508  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.98 
 
 		 549 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.408187 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0274  nitrate reductase, beta subunit  35.49 
 
 		 512 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  36.68 
 
 		 491 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0298  respiratory nitrate reductase, beta subunit  34.53 
 
 		 512 aa  259  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.609381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0901  nitrate reductase, beta subunit  38.69 
 
 		 561 aa  259  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  36.68 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  34.94 
 
 		 512 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  35.37 
 
 		 517 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4545  nitrate reductase, beta subunit  37.41 
 
 		 550 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3674  nitrate reductase, beta subunit  38.69 
 
 		 561 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364422  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1250  nitrate reductase, beta subunit  35.21 
 
 		 509 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1331  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.15 
 
 		 519 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6463  nitrate reductase, beta subunit  35.77 
 
 		 511 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1021  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.28 
 
 		 495 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0219724 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5384  nitrate reductase, beta subunit  35.2 
 
 		 511 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302612  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  35.52 
 
 		 511 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  36.78 
 
 		 508 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1986  respiratory nitrate reductase, beta subunit  36 
 
 		 517 aa  256  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  35.77 
 
 		 509 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11187  respiratory nitrate reductase beta subunit narH  37.05 
 
 		 558 aa  256  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  36.02 
 
 		 513 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1955  respiratory nitrate reductase beta subuni  35.04 
 
 		 512 aa  255  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.089713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  36.02 
 
 		 513 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5212  nitrate reductase subunit beta  36.38 
 
 		 560 aa  255  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  0.717062 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2420  nitrate reductase, beta subunit  34.76 
 
 		 519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3700  nitrate reductase, beta subunit  34.99 
 
 		 554 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.02 
 
 		 511 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1825  nitrate reductase, beta subunit  35.73 
 
 		 559 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1002  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.11 
 
 		 527 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2039  nitrate reductase, beta subunit  37.84 
 
 		 511 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2468  nitrate reductase, beta subunit  34.76 
 
 		 519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1762  nitrate reductase, beta subunit  36.58 
 
 		 566 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00378807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  35.77 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  35.58 
 
 		 489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3447  nitrate reductase, beta subunit  33.96 
 
 		 513 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.338628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  35.04 
 
 		 512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  36.84 
 
 		 514 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2804  nitrate reductase, beta subunit  35.97 
 
 		 558 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.477441  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  36.32 
 
 		 507 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2127  nitrate reductase, beta subunit  35.93 
 
 		 509 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4235  nitrate reductase, beta subunit  35.77 
 
 		 505 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312126  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0965  nitrate reductase, beta subunit  34.03 
 
 		 513 aa  252  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3289  nitrate reductase, beta subunit  37.23 
 
 		 513 aa  252  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0366444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1854  nitrate reductase, beta subunit  36.02 
 
 		 520 aa  252  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  35.52 
 
 		 507 aa  252  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  35.61 
 
 		 507 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1262  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.45 
 
 		 551 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1279  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.45 
 
 		 551 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.319698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.61 
 
 		 507 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1509  nitrate reductase, beta subunit  35.77 
 
 		 504 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0776  nitrate reductase, beta subunit  34.72 
 
 		 513 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1288  nitrate reductase, beta subunit  36.45 
 
 		 551 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1772  nitrate reductase, beta subunit  36.02 
 
 		 520 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01203  nitrate reductase 1, beta (Fe-S) subunit  35.18 
 
 		 512 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.714292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1335  nitrate reductase, beta subunit  35.18 
 
 		 512 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00571547  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2420  nitrate reductase, beta subunit  35.18 
 
 		 512 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0556426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2398  nitrate reductase, beta subunit  35.18 
 
 		 512 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5003  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.79 
 
 		 515 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248007  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1709  nitrate reductase 1, beta subunit  35.18 
 
 		 512 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0253644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1707  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.6 
 
 		 510 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01213  hypothetical protein  35.18 
 
 		 512 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.552443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1914  nitrate reductase 1, beta subunit  35.18 
 
 		 512 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.288869  normal  0.118614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.75 
 
 		 510 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1376  nitrate reductase, beta subunit  35.18 
 
 		 512 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0922315  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  33.11 
 
 		 514 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1393  nitrate reductase 1, beta subunit  35.18 
 
 		 512 aa  249  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0249  nitrate reductase, beta subunit  36.24 
 
 		 502 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0794164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  35.24 
 
 		 513 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0315  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.44 
 
 		 557 aa  248  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  35.43 
 
 		 514 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  36.02 
 
 		 521 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0178  nitrate reductase, beta subunit  38.12 
 
 		 539 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>