More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1021 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0776  nitrate reductase, beta subunit  60.35 
 
 		 513 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0965  nitrate reductase, beta subunit  60.16 
 
 		 513 aa  646    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1021  respiratory nitrate reductase beta subunit  100 
 
 		 495 aa  1023    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0219724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2171  respiratory nitrate reductase beta subunit  64.91 
 
 		 489 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3289  nitrate reductase, beta subunit  60.16 
 
 		 513 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0366444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3447  nitrate reductase, beta subunit  60.94 
 
 		 513 aa  653    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.338628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1778  nitrate reductase, beta subunit  64.71 
 
 		 489 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1707  nitrate reductase, beta subunit  64.91 
 
 		 489 aa  668    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0249  nitrate reductase, beta subunit  58.76 
 
 		 502 aa  629  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0794164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3596  nitrate reductase, beta subunit  58.44 
 
 		 485 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.989414  hitchhiker  0.00578955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0330  respiratory nitrate reductase beta subunit  52.29 
 
 		 484 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000947818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2653  nitrate reductase, beta subunit  53.54 
 
 		 483 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0204  nitrate reductase, beta subunit  53.06 
 
 		 483 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  51.43 
 
 		 538 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1772  nitrate reductase, beta subunit  53.07 
 
 		 520 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2563  nitrate reductase, beta subunit  51.36 
 
 		 526 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.219969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01203  nitrate reductase 1, beta (Fe-S) subunit  52.2 
 
 		 512 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.714292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1376  nitrate reductase, beta subunit  52.2 
 
 		 512 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0922315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2420  nitrate reductase, beta subunit  51.99 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0556426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1914  nitrate reductase 1, beta subunit  51.99 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.288869  normal  0.118614 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2398  nitrate reductase, beta subunit  52.2 
 
 		 512 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1393  nitrate reductase 1, beta subunit  52.2 
 
 		 512 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  51.78 
 
 		 521 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1709  nitrate reductase 1, beta subunit  52.2 
 
 		 512 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0253644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1335  nitrate reductase, beta subunit  51.99 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00571547  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01213  hypothetical protein  52.2 
 
 		 512 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.552443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  48.57 
 
 		 491 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  48.37 
 
 		 491 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  48.16 
 
 		 491 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  48.16 
 
 		 491 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2039  nitrate reductase, beta subunit  51.98 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2157  nitrate reductase, beta subunit  52.55 
 
 		 550 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2758  nitrate reductase, beta subunit  49.29 
 
 		 517 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  47.96 
 
 		 491 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11187  respiratory nitrate reductase beta subunit narH  51.91 
 
 		 558 aa  501  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1854  nitrate reductase, beta subunit  51.47 
 
 		 520 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  50.61 
 
 		 509 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1707  respiratory nitrate reductase beta subunit  52.94 
 
 		 510 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2626  nitrate reductase, beta subunit  49.29 
 
 		 517 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2682  nitrate reductase, beta subunit  49.29 
 
 		 517 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  51.05 
 
 		 511 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1732  nitrate reductase, beta subunit  49.09 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1853  nitrate reductase, beta subunit  49.09 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  49.9 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3085  nitrate reductase, beta subunit  50 
 
 		 525 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2242  nitrate reductase, beta subunit  49.09 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0484783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3076  nitrate reductase, beta subunit  49.09 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1825  nitrate reductase, beta subunit  51.56 
 
 		 559 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2882  nitrate reductase, beta subunit  50 
 
 		 514 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2804  nitrate reductase, beta subunit  50.84 
 
 		 558 aa  495  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.477441  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1515  nitrate reductase, beta subunit  49.09 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1899  nitrate reductase 1, beta subunit  49.79 
 
 		 511 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.404395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  48.48 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1894  nitrate reductase 1, beta subunit  49.79 
 
 		 511 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.256537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  48.68 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1331  respiratory nitrate reductase beta subunit  50.31 
 
 		 519 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2227  respiratory nitrate reductase beta subunit  49.48 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.414586  normal  0.0461834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2303  respiratory nitrate reductase beta subunit  49.48 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.932469  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1377  nitrate reductase 1, beta subunit  49.79 
 
 		 511 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  50.82 
 
 		 509 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  50.31 
 
 		 584 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4545  nitrate reductase, beta subunit  51.82 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3760  nitrate reductase, beta subunit  50.1 
 
 		 510 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.281422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  48.68 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  51.61 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  47.65 
 
 		 489 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1762  nitrate reductase, beta subunit  50.31 
 
 		 566 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00378807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  47.96 
 
 		 517 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  49.69 
 
 		 512 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  50.3 
 
 		 508 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1958  nitrate reductase 1 subunit beta  49.79 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2892  nitrate reductase, beta subunit  48.88 
 
 		 512 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161802  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1560  nitrate reductase 1 subunit beta  49.89 
 
 		 512 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.713297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  50 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1648  nitrate reductase, beta subunit  50 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0298  respiratory nitrate reductase, beta subunit  48.98 
 
 		 512 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.609381  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  48.88 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  49.8 
 
 		 507 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1250  nitrate reductase, beta subunit  50 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1262  respiratory nitrate reductase beta subunit  52.25 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  48.79 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5384  nitrate reductase, beta subunit  50.85 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302612  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01437  hypothetical protein  50 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1279  respiratory nitrate reductase beta subunit  52.25 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.319698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  50 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  48.79 
 
 		 519 aa  485  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1236  nitrate reductase, beta subunit  49.59 
 
 		 507 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.222412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1906  respiratory nitrate reductase beta subunit  49.89 
 
 		 473 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1288  nitrate reductase, beta subunit  52.25 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2063  respiratory nitrate reductase beta subunit  50.42 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  49.39 
 
 		 508 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  49.79 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1986  respiratory nitrate reductase, beta subunit  46.76 
 
 		 517 aa  482  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  49.15 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1955  respiratory nitrate reductase beta subuni  48.88 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.089713 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6463  nitrate reductase, beta subunit  50.42 
 
 		 511 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  50 
 
 		 511 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0508  respiratory nitrate reductase beta subunit  50.21 
 
 		 549 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.408187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2077  nitrate reductase 2, beta subunit  50 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0178  nitrate reductase, beta subunit  51.81 
 
 		 539 aa  482  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>