27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0154 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  100 
 
 
359 aa  732    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  63.07 
 
 
358 aa  457  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  39.44 
 
 
358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  39.65 
 
 
355 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  39.72 
 
 
364 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  39.45 
 
 
358 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  36.74 
 
 
323 aa  182  7e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  33.99 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  29.05 
 
 
390 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  29.05 
 
 
390 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  28.72 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  28.47 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  29.32 
 
 
384 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  28.52 
 
 
383 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  32.68 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  27.07 
 
 
391 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  27.04 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  33.33 
 
 
600 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  32.58 
 
 
516 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  35.11 
 
 
519 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  26.52 
 
 
585 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  33.08 
 
 
552 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  29.51 
 
 
464 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  30.68 
 
 
610 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  25.17 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  26.76 
 
 
282 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0036  hypothetical protein  27.89 
 
 
279 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>