More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1909 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
318 aa  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.35 
 
 
332 aa  585  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2515  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.92 
 
 
333 aa  522  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.75499  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.38 
 
 
339 aa  434  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.47 
 
 
338 aa  426  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.54 
 
 
338 aa  421  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.66 
 
 
333 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.3 
 
 
333 aa  411  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.02 
 
 
345 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.3 
 
 
333 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.94 
 
 
334 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.86 
 
 
351 aa  413  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.9 
 
 
333 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.94 
 
 
334 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 
333 aa  408  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 
336 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 
336 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 
336 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 
338 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 
338 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 
333 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 
334 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 
334 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.3 
 
 
333 aa  407  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.38 
 
 
541 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.62 
 
 
333 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 
333 aa  408  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.55 
 
 
342 aa  408  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 
334 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
334 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 
334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 
355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.29 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 
334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  60.65 
 
 
336 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
336 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
336 aa  401  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
336 aa  401  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.06 
 
 
345 aa  401  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.77 
 
 
337 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 
358 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
334 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.38 
 
 
363 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 
334 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
336 aa  401  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
336 aa  401  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 
344 aa  401  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
336 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
336 aa  401  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
334 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
336 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  60.65 
 
 
336 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 
334 aa  401  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
334 aa  401  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.74 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.06 
 
 
341 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.77 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.77 
 
 
355 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
336 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.6 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
336 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
334 aa  395  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.51 
 
 
336 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.51 
 
 
336 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
338 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 
336 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 
337 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.58 
 
 
352 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 
346 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
337 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 
335 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 
336 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.93 
 
 
337 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.38 
 
 
356 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.38 
 
 
356 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.52 
 
 
356 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.09 
 
 
348 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.37 
 
 
350 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
356 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.38 
 
 
356 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.12 
 
 
361 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.38 
 
 
356 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 
334 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>