53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1781 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  51.61 
 
 		 703 aa  727    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  79.19 
 
 		 716 aa  1206    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  56.02 
 
 		 706 aa  790    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  55.32 
 
 		 711 aa  806    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  79.33 
 
 		 716 aa  1208    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  79.19 
 
 		 716 aa  1207    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  79.33 
 
 		 716 aa  1208    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  87.5 
 
 		 712 aa  1314    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  87.08 
 
 		 712 aa  1310    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 712 aa  1463    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  87.92 
 
 		 712 aa  1318    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  42.33 
 
 		 698 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  38.26 
 
 		 699 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  38.14 
 
 		 703 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  37.07 
 
 		 699 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  36.26 
 
 		 695 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  35.94 
 
 		 695 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  36.26 
 
 		 695 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  36.74 
 
 		 698 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  35.65 
 
 		 695 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  35.16 
 
 		 695 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  35.93 
 
 		 697 aa  429  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  36.6 
 
 		 695 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  36.6 
 
 		 695 aa  429  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  36.6 
 
 		 695 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  34.33 
 
 		 693 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  35.29 
 
 		 704 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  31.72 
 
 		 668 aa  331  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  31.59 
 
 		 668 aa  323  8e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  29.49 
 
 		 662 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  29.36 
 
 		 667 aa  302  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  29.49 
 
 		 662 aa  301  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  29.83 
 
 		 672 aa  300  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  29.56 
 
 		 667 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  28.87 
 
 		 669 aa  298  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  29.65 
 
 		 669 aa  297  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  28.67 
 
 		 668 aa  296  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  28.94 
 
 		 667 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  28.17 
 
 		 668 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  27.97 
 
 		 674 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  27.3 
 
 		 672 aa  227  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  26.41 
 
 		 669 aa  195  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  24.4 
 
 		 656 aa  144  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  23.28 
 
 		 660 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  21.62 
 
 		 681 aa  118  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  24.05 
 
 		 706 aa  114  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  23.51 
 
 		 565 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  22.22 
 
 		 573 aa  92.4  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  22.16 
 
 		 807 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  22.4 
 
 		 830 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  21.2 
 
 		 835 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  26.98 
 
 		 810 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 729 aa  43.9  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>