29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0366 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  90.81 
 
 		 272 aa  524  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  82.58 
 
 		 287 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  80.22 
 
 		 277 aa  454  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  87.08 
 
 		 221 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  61.79 
 
 		 260 aa  314  8e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  57.03 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  56.64 
 
 		 305 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  52.28 
 
 		 323 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  56.64 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  60.44 
 
 		 251 aa  295  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  64.41 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  62.78 
 
 		 236 aa  291  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  58.1 
 
 		 213 aa  268  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  60 
 
 		 229 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  54.05 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  38.31 
 
 		 211 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  36.27 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  25.76 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  24.75 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  26 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  22.17 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  27.05 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  26.17 
 
 		 524 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  21.83 
 
 		 476 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  24.76 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  29.6 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  24.02 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0274676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>