25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0198 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  28.1 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  29.17 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  28.07 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  29.21 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  30.83 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  28.36 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  27.91 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  29.02 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  28.36 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  27.67 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  25.51 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  29.38 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  25.72 
 
 		 349 aa  85.9  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  26.18 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  25.42 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  26.22 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  25.74 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  23.6 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0813  hypothetical protein  28.19 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  25.64 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1191  hypothetical protein  26.4 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0345  hypothetical protein  24.65 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  23.91 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2523  hypothetical protein  22.19 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>