20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0189 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1594  sex pilus assembly  55.33 
 
 		 1145 aa  1163    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  100 
 
 		 1204 aa  2459    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0376  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1172 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276415  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  24.31 
 
 		 919 aa  90.1  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4272  hypothetical protein  20.2 
 
 		 1776 aa  88.6  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1068  pilus assembly protein TraG, putative  21.88 
 
 		 1218 aa  83.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1136 aa  77  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1093 aa  67.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  24.64 
 
 		 924 aa  58.2  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  19.77 
 
 		 938 aa  56.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0305  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1205 aa  54.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  20.68 
 
 		 935 aa  53.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  22.73 
 
 		 960 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0243  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1199 aa  53.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  30.17 
 
 		 923 aa  53.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  28.45 
 
 		 923 aa  51.6  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  20.86 
 
 		 1313 aa  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  21.63 
 
 		 940 aa  49.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  18.72 
 
 		 900 aa  49.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  20.65 
 
 		 1051 aa  46.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>