More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0022 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 1548 bp  975    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 1548 bp  975    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 1473 bp  789    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  83.95 
 
 		 1473 bp  789    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 		 1692 bp  870    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 1532 bp  761    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  85.35 
 
 		 1548 bp  922    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 1548 bp  906    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0039  16S ribosomal RNA  88.76 
 
 		 1497 bp  793    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000419568  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 1431 bp  787    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0030  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1554 bp  652    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0532181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1431 bp  795    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1466 bp  795    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0032  16S ribosomal RNA  85.1 
 
 		 1550 bp  896    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0577345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1532 bp  763    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1532 bp  763    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  84.53 
 
 		 1692 bp  870    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1466 bp  795    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 1532 bp  761    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01550  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1505 bp  771    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1498 bp  688    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0043  16S ribosomal RNA  85.1 
 
 		 1550 bp  896    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1548 bp  914    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0012  16S ribosomal RNA  88.76 
 
 		 1497 bp  793    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000389659  normal  0.664476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  86.83 
 
 		 1526 bp  829    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0046  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 		 1500 bp  733    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  85.35 
 
 		 1548 bp  922    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0052  16S ribosomal RNA  85.9 
 
 		 1471 bp  646    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0176979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  85.9 
 
 		 1471 bp  646    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1555 bp  1128    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1513 bp  2999    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  84 
 
 		 1532 bp  801    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  84.08 
 
 		 1532 bp  809    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0013  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1555 bp  751    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000280692  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0051  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1555 bp  751    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0056  16S ribosomal RNA  88.76 
 
 		 1497 bp  793    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000319256  normal  0.0498462 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  85.97 
 
 		 1551 bp  987    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  85.97 
 
 		 1551 bp  987    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  85.97 
 
 		 1551 bp  987    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  85.97 
 
 		 1551 bp  987    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  86.62 
 
 		 1525 bp  813    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1568 bp  1005    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1498 bp  688    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1568 bp  1005    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08380  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1505 bp  771    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.793427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  90.85 
 
 		 1536 bp  632  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0011  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 		 1542 bp  632  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0073  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 		 1542 bp  632  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1546 bp  630  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1546 bp  630  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1546 bp  630  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1546 bp  630  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1546 bp  630  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1546 bp  630  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1546 bp  630  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1546 bp  630  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1541 bp  628  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1541 bp  628  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0030  16S ribosomal RNA  82.14 
 
 		 1563 bp  613  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000298202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1548 bp  609  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1548 bp  609  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0016  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1517 bp  605  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.672174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0021  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1517 bp  605  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0029  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1517 bp  605  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0064  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1517 bp  605  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0067  16S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 1517 bp  605  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1671 bp  597  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0073  16S ribosomal RNA  84 
 
 		 1661 bp  589  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000134012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0006  16S ribosomal RNA  84 
 
 		 1554 bp  589  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00174832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1546 bp  587  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0001  16S ribosomal RNA  81.91 
 
 		 1519 bp  581  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  84.82 
 
 		 1546 bp  579  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  84.84 
 
 		 1544 bp  567  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  84.86 
 
 		 1544 bp  563  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0038  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1544 bp  563  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0070  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1544 bp  563  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000375741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 1545 bp  565  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0001  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1544 bp  563  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 1545 bp  565  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0018  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1544 bp  563  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 1544 bp  559  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 1550 bp  561  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 1550 bp  561  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 1554 bp  557  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0011  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1542 bp  557  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0038  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1542 bp  557  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 1554 bp  557  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25530  16S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 1527 bp  553  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07440  16S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 1527 bp  553  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.496613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05560  16S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 1527 bp  553  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  84.34 
 
 		 1563 bp  541  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  84.34 
 
 		 1563 bp  541  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  84.03 
 
 		 1530 bp  535  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  84.03 
 
 		 1689 bp  535  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  85.65 
 
 		 1510 bp  533  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>