82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2541 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
341 aa  702    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  61.11 
 
 
342 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  61.01 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  59.88 
 
 
334 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  57.61 
 
 
346 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  57.97 
 
 
346 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  56.65 
 
 
345 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  59.27 
 
 
334 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  57.02 
 
 
342 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  57.99 
 
 
339 aa  388  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  58.56 
 
 
334 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  58.06 
 
 
344 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  57.06 
 
 
334 aa  385  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  57.06 
 
 
334 aa  385  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  57.6 
 
 
346 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  56.98 
 
 
343 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  56.4 
 
 
344 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  56.73 
 
 
341 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  56.05 
 
 
339 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  56.47 
 
 
341 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  57.96 
 
 
343 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  56.76 
 
 
341 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  57.27 
 
 
343 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  55.04 
 
 
347 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  57.4 
 
 
338 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  55.92 
 
 
340 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  55.52 
 
 
335 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  56.8 
 
 
340 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  55.49 
 
 
341 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  56.56 
 
 
342 aa  363  2e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  53.71 
 
 
343 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  53.82 
 
 
341 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  54.35 
 
 
340 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  53.82 
 
 
341 aa  350  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  50.89 
 
 
348 aa  350  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  52.35 
 
 
359 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  54.01 
 
 
339 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  52.65 
 
 
341 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  52.06 
 
 
341 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  52.08 
 
 
339 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  51.2 
 
 
355 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  50.6 
 
 
355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  47.77 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  47.77 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  53.66 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  49.09 
 
 
355 aa  308  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  48.12 
 
 
336 aa  305  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  48.48 
 
 
355 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  49.39 
 
 
355 aa  302  5.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  51.45 
 
 
327 aa  295  7e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  45.65 
 
 
401 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  42.35 
 
 
350 aa  232  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  45.29 
 
 
241 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.99 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.55 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.55 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.55 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.68 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.97 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.22 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.28 
 
 
296 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  33.15 
 
 
298 aa  52.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.37 
 
 
296 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30.05 
 
 
298 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.37 
 
 
296 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.79 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.79 
 
 
296 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.94 
 
 
300 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3550  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.12 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.02 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.71 
 
 
296 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.22 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3578  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 
298 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.674001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.38 
 
 
306 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.982462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.41 
 
 
295 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.21 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1693  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.38 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42447  cytosolic aldolase  26.46 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.38 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0085  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.88 
 
 
296 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.249059  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.25 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.39 
 
 
299 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal  0.10767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>