63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4773 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
347 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  83.48 
 
 
346 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  83 
 
 
342 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  80.69 
 
 
344 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  78.32 
 
 
343 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  76.88 
 
 
343 aa  558  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  71.97 
 
 
346 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  71.22 
 
 
341 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  68.05 
 
 
341 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  67.66 
 
 
339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  64.71 
 
 
341 aa  447  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  62.43 
 
 
345 aa  441  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  64.71 
 
 
341 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  63.82 
 
 
341 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  63.53 
 
 
341 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  61.18 
 
 
341 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  62.46 
 
 
341 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  58.77 
 
 
342 aa  393  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  59.36 
 
 
340 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  55.03 
 
 
334 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  56.1 
 
 
344 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  55.04 
 
 
341 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  54.39 
 
 
338 aa  368  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  54.19 
 
 
339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  53.1 
 
 
334 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  52.66 
 
 
334 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  52.17 
 
 
342 aa  359  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  55.39 
 
 
343 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  54.23 
 
 
340 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  53.25 
 
 
334 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  53.25 
 
 
334 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  54.25 
 
 
340 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  50.72 
 
 
348 aa  354  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  51.45 
 
 
346 aa  349  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  52.17 
 
 
339 aa  342  8e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  52.21 
 
 
343 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  50.3 
 
 
339 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  51.75 
 
 
339 aa  325  9e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  47.66 
 
 
336 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  47.37 
 
 
336 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  52.35 
 
 
327 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  50.59 
 
 
337 aa  301  9e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  48.35 
 
 
355 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  46.9 
 
 
335 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.35 
 
 
355 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  47.68 
 
 
336 aa  299  5e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  45.91 
 
 
359 aa  298  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  46.73 
 
 
355 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.83 
 
 
355 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  44.84 
 
 
401 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  46.92 
 
 
355 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  39.94 
 
 
350 aa  219  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  45.81 
 
 
241 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.06 
 
 
300 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.8 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.19 
 
 
298 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.51 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.6 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.03 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.06 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.96 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.96 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.96 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>