80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2993 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 343 aa  692    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  65.45 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  64.43 
 
 		 359 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  62.16 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  62.46 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  60.36 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  57.91 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  58.33 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  58.82 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  57.96 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  56.59 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  55.99 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  55.99 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  56.12 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  56.89 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  55.33 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  55.29 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  56.89 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  56.72 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  59.58 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  54.63 
 
 		 341 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  55.39 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  54.63 
 
 		 341 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  55.82 
 
 		 341 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  55.39 
 
 		 338 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  53.85 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  56.16 
 
 		 342 aa  352  5e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  53.73 
 
 		 341 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  54.19 
 
 		 343 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  53.24 
 
 		 341 aa  349  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  53.85 
 
 		 343 aa  346  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  52.98 
 
 		 342 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  52.99 
 
 		 339 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  53.55 
 
 		 344 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  54.49 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  52.21 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  53.25 
 
 		 343 aa  339  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  54.19 
 
 		 340 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  54.57 
 
 		 339 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  57.14 
 
 		 327 aa  325  5e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  50.3 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  48.35 
 
 		 336 aa  316  4e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  48.05 
 
 		 336 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  51.21 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.36 
 
 		 355 aa  301  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  48.19 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  48.06 
 
 		 355 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  50.45 
 
 		 401 aa  298  9e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  47.63 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.29 
 
 		 355 aa  292  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  47.76 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  41.78 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  47.44 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3550  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.2 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.56 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  33.75 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.41 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30.7 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.982462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.8 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.61 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.89 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.89 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30.95 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30.51 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.46 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42447  cytosolic aldolase  24.61 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.47 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.55 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.55 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.55 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.09 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.89 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3578  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.17 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.674001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.68 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.59 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1693  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.79 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.27 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.09 
 
 		 296 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2273  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.74 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>