61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3539 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  94.72 
 
 
341 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
341 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  82.11 
 
 
341 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  79.47 
 
 
341 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  75.07 
 
 
341 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  74.49 
 
 
341 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  68.42 
 
 
342 aa  471  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  67.54 
 
 
339 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  65.49 
 
 
346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  65.49 
 
 
341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  66.27 
 
 
342 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  65.12 
 
 
341 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  65.88 
 
 
344 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  64.12 
 
 
343 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  63.53 
 
 
347 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  62.35 
 
 
343 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  60.18 
 
 
346 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  59.36 
 
 
345 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  55.26 
 
 
344 aa  363  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  56.47 
 
 
340 aa  359  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  53.89 
 
 
334 aa  358  5e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  54.28 
 
 
338 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  54.19 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  53.73 
 
 
343 aa  352  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  55.15 
 
 
339 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  52.63 
 
 
342 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  52.35 
 
 
340 aa  348  9e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  52.55 
 
 
334 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  53.19 
 
 
340 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  50.14 
 
 
346 aa  341  9e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  53.19 
 
 
339 aa  340  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  52.65 
 
 
341 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  54.94 
 
 
343 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  51.49 
 
 
339 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  52.1 
 
 
334 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  52.1 
 
 
334 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  49.56 
 
 
348 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  53.94 
 
 
339 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  49.26 
 
 
336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  48.96 
 
 
336 aa  325  5e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  50.45 
 
 
335 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  54.17 
 
 
327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  46.09 
 
 
359 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  50.3 
 
 
337 aa  295  5e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  48.29 
 
 
336 aa  291  9e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.9 
 
 
355 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  47.9 
 
 
355 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  46.15 
 
 
401 aa  289  6e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  47.45 
 
 
355 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.45 
 
 
355 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  47.35 
 
 
355 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  36.98 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  47.35 
 
 
241 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.21 
 
 
295 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.09 
 
 
294 aa  46.2  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.27 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.62 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.11 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.37 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.96 
 
 
296 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.86 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>