66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0177 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
327 aa  659    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  54.55 
 
 
346 aa  355  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  56.57 
 
 
341 aa  342  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  51.67 
 
 
334 aa  342  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  52.28 
 
 
334 aa  341  8e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  56.52 
 
 
343 aa  341  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  52.58 
 
 
334 aa  341  9e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  52.58 
 
 
334 aa  341  9e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  53.07 
 
 
343 aa  338  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  52.55 
 
 
345 aa  338  9e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  54.57 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  54.57 
 
 
343 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  54.24 
 
 
343 aa  335  7e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  53.82 
 
 
341 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  52.89 
 
 
334 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  52.92 
 
 
339 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  55.35 
 
 
346 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  53.66 
 
 
341 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  54.74 
 
 
341 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  53.21 
 
 
341 aa  329  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  53.52 
 
 
341 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  53.68 
 
 
342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  53.78 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  53.21 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  55.18 
 
 
340 aa  326  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  52.74 
 
 
344 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  53.07 
 
 
344 aa  323  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  52.74 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  50.61 
 
 
348 aa  318  7e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  51.83 
 
 
338 aa  316  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  51.2 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  52.81 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  50.61 
 
 
340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  53.73 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  50.77 
 
 
341 aa  311  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  49.23 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  49.08 
 
 
339 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  50.61 
 
 
339 aa  308  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  51.06 
 
 
342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  47.09 
 
 
336 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  46.79 
 
 
336 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  49.25 
 
 
359 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  49.39 
 
 
337 aa  291  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  48.79 
 
 
335 aa  286  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  46.01 
 
 
355 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  44.07 
 
 
355 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.77 
 
 
355 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  44.23 
 
 
336 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  42.94 
 
 
355 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.24 
 
 
355 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  40.48 
 
 
401 aa  241  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  38.03 
 
 
350 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  44.59 
 
 
241 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.95 
 
 
296 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30.57 
 
 
294 aa  52  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30.33 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.77 
 
 
296 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.45 
 
 
299 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.39 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.92 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.78 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.78 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3578  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.17 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.674001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.63 
 
 
296 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.36 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>