63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4317 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 342 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  91.62 
 
 		 346 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  88.95 
 
 		 344 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  83 
 
 		 347 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  81.63 
 
 		 343 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  79.01 
 
 		 343 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  74.12 
 
 		 341 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  71.35 
 
 		 346 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  68.77 
 
 		 341 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  69.88 
 
 		 339 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  66.87 
 
 		 341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  66.87 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  66.27 
 
 		 341 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  66.87 
 
 		 341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  65.97 
 
 		 341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  68.06 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  62.9 
 
 		 345 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  61.9 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  56.89 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  57.02 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  60.77 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  55.88 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  56.12 
 
 		 343 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  54.79 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  54.35 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  54.28 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  53.73 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  55.42 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  53.39 
 
 		 342 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  54.87 
 
 		 340 aa  361  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  53.75 
 
 		 334 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  53.75 
 
 		 334 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  52.52 
 
 		 346 aa  357  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  50.88 
 
 		 348 aa  355  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  52.99 
 
 		 339 aa  352  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  52.65 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  52.98 
 
 		 343 aa  345  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  53.25 
 
 		 339 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  49.55 
 
 		 336 aa  332  8e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  49.26 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  54.79 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  50.15 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  50.15 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  47.9 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  53.43 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  50.31 
 
 		 336 aa  305  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  50.44 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  48.35 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.05 
 
 		 355 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  45.64 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  45.57 
 
 		 401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  40 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  49.78 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.54 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.09 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.87 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.52 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.52 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.52 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.07 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.59 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.96 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.21 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>