64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4471 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  89.66 
 
 		 344 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  91.62 
 
 		 342 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 346 aa  714    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  83.48 
 
 		 347 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  80.98 
 
 		 343 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  77.52 
 
 		 343 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  76.74 
 
 		 341 aa  528  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  71.68 
 
 		 346 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  70.09 
 
 		 341 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  70.24 
 
 		 339 aa  481  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  66.96 
 
 		 341 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  66.96 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  68.73 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  66.37 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  67.26 
 
 		 341 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  65.49 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  63.04 
 
 		 345 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  61.01 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  57.97 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  60.93 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  57.1 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  54.25 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  54.3 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  54.94 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  55.46 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  55.26 
 
 		 340 aa  364  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  53.69 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  53.64 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  54.3 
 
 		 334 aa  362  4e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  54.3 
 
 		 334 aa  362  4e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  54.46 
 
 		 340 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  53.1 
 
 		 334 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  53.25 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  53.85 
 
 		 343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  50.29 
 
 		 348 aa  349  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  52.37 
 
 		 339 aa  346  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  51.74 
 
 		 339 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  51.75 
 
 		 339 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  48.39 
 
 		 336 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  48.09 
 
 		 336 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  48.81 
 
 		 335 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  55.41 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  50.6 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  50.6 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  53.57 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  49.07 
 
 		 336 aa  309  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  49.1 
 
 		 355 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  47.93 
 
 		 359 aa  301  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.8 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  50 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  46.39 
 
 		 401 aa  292  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  40.71 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  48.51 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.81 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.87 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.02 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.02 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.02 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.25 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.61 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.01 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.6 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.88 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.09 
 
 		 296 aa  43.1  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>