59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6929 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 346 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  74.93 
 
 		 343 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  71.68 
 
 		 346 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  72.01 
 
 		 344 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  71.97 
 
 		 347 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  73.47 
 
 		 343 aa  510  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  71.35 
 
 		 342 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  67.66 
 
 		 341 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  66.08 
 
 		 341 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  64.29 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  62.32 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  63.99 
 
 		 341 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  62.54 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  61.36 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  60.18 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  59.29 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  59.88 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  60.18 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  57.6 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  59.76 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  56.89 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  56.6 
 
 		 344 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  54.35 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  55.16 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  55.46 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  53.45 
 
 		 334 aa  360  3e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  53.45 
 
 		 334 aa  360  3e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  54.35 
 
 		 334 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  53.92 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  56.97 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  54.63 
 
 		 343 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  55.69 
 
 		 340 aa  345  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  54.49 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  51.64 
 
 		 339 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  50.75 
 
 		 346 aa  332  5e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  48.82 
 
 		 348 aa  332  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  52.82 
 
 		 339 aa  325  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  48.07 
 
 		 336 aa  317  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  49.85 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  48.07 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  56.81 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  53.05 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  48.09 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  49.1 
 
 		 335 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  46.81 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.13 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.11 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  46.43 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  46.86 
 
 		 336 aa  290  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  46.79 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  49.09 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  40.52 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  44.44 
 
 		 241 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.79 
 
 		 301 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.31 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.65 
 
 		 298 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.12 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.21 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.17 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>