56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2654 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 341 aa  693    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  80.35 
 
 		 341 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  79.47 
 
 		 341 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  76.54 
 
 		 341 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  73.9 
 
 		 341 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  73.61 
 
 		 341 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  68.42 
 
 		 339 aa  464  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  68.25 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  67.25 
 
 		 342 aa  456  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  66.96 
 
 		 341 aa  455  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  67.26 
 
 		 346 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  66.57 
 
 		 341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  66.87 
 
 		 342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  66.18 
 
 		 343 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  64.71 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  62.46 
 
 		 347 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  60.82 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  60.18 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  56.43 
 
 		 344 aa  362  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  55.99 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  54.97 
 
 		 342 aa  358  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  55.82 
 
 		 343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  58.53 
 
 		 340 aa  355  5.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  55.88 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  52.62 
 
 		 346 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  53.82 
 
 		 341 aa  350  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  54.95 
 
 		 334 aa  349  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  54.57 
 
 		 338 aa  348  9e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  56.8 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  55.45 
 
 		 340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  55.86 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  54.35 
 
 		 334 aa  342  4e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  54.35 
 
 		 334 aa  342  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  54.05 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  51.49 
 
 		 339 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  53.61 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  54.98 
 
 		 339 aa  325  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  50.15 
 
 		 348 aa  322  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  54.31 
 
 		 327 aa  317  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  50.45 
 
 		 335 aa  315  8e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  48.07 
 
 		 336 aa  309  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  47.77 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  47.98 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  48.2 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  52.42 
 
 		 337 aa  292  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.9 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.77 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  47.77 
 
 		 355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  46.73 
 
 		 336 aa  285  8e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  46.71 
 
 		 401 aa  281  9e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  47.77 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  37.82 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  47.35 
 
 		 241 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.53 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.2 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.67 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>