61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2105 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
339 aa  694    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  73.98 
 
 
341 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  71.93 
 
 
341 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  70.97 
 
 
341 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  70.24 
 
 
341 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  70.66 
 
 
344 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  70.24 
 
 
346 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  70.03 
 
 
343 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  68.13 
 
 
341 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  69.88 
 
 
342 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  67.66 
 
 
347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  68.42 
 
 
341 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  67.54 
 
 
341 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  66.96 
 
 
341 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  67.36 
 
 
343 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  64.9 
 
 
345 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  64.29 
 
 
346 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  64.43 
 
 
342 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  63.14 
 
 
334 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  61.93 
 
 
334 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  62.24 
 
 
344 aa  420  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  60.3 
 
 
334 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  61.13 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  62.02 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  61.01 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  61.42 
 
 
340 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  60.42 
 
 
334 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  60.42 
 
 
334 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  58.91 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  56.93 
 
 
342 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  56.08 
 
 
346 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  55.99 
 
 
339 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  55.29 
 
 
343 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  55.12 
 
 
343 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  54.65 
 
 
340 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  53.29 
 
 
339 aa  352  7e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  50.6 
 
 
348 aa  347  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  54.49 
 
 
339 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  50.6 
 
 
336 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  50.6 
 
 
336 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  52.41 
 
 
335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  49.57 
 
 
359 aa  331  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  54.67 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  53.33 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  49.7 
 
 
355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  49.09 
 
 
355 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.79 
 
 
355 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  48.79 
 
 
355 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  49.35 
 
 
355 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  46.86 
 
 
336 aa  287  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  44.16 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  40.42 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  45.49 
 
 
241 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.11 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.89 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.28 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.38 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.34 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.34 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.72 
 
 
301 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.18 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>