59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3534 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  89.21 
 
 		 343 aa  638    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 343 aa  704    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  81.63 
 
 		 344 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  80.98 
 
 		 346 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  81.63 
 
 		 342 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  78.32 
 
 		 347 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  74.93 
 
 		 346 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  72.35 
 
 		 341 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  70.03 
 
 		 339 aa  478  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  66.47 
 
 		 341 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  68.24 
 
 		 341 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  67.06 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  64.41 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  66.18 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  64.12 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  64.71 
 
 		 341 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  62.32 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  62.35 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  60.47 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  58.04 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  56.98 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  57.02 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  55.65 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  54.2 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  55.75 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  55.95 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  55.82 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  56.18 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  55.19 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  54.46 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  54.46 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  54.01 
 
 		 334 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  52.94 
 
 		 346 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  53.24 
 
 		 339 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  53.85 
 
 		 343 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  52.54 
 
 		 339 aa  341  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  50.44 
 
 		 348 aa  335  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  52.21 
 
 		 339 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  49.85 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  49.85 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  53.73 
 
 		 337 aa  322  4e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  55.41 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  49.4 
 
 		 355 aa  308  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  49.4 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  49.1 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  49.4 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  48.12 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  47.08 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  45.65 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  49.12 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  47.02 
 
 		 335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  41.94 
 
 		 350 aa  235  6e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  47.66 
 
 		 241 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.08 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.47 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.53 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.07 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.01 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>