53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0085 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0085  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 296 aa  614  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  93.92 
 
 		 296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2273  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.65 
 
 		 296 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.76 
 
 		 299 aa  363  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.99 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3550  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.68 
 
 		 300 aa  360  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.21 
 
 		 306 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.982462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.76 
 
 		 300 aa  354  8.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.19 
 
 		 294 aa  345  6e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.42 
 
 		 298 aa  342  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.14 
 
 		 297 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.14 
 
 		 297 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.14 
 
 		 297 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.42 
 
 		 295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42447  cytosolic aldolase  53.61 
 
 		 299 aa  332  3e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134793  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.64 
 
 		 294 aa  331  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1693  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  52.38 
 
 		 296 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.14 
 
 		 296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.36 
 
 		 296 aa  328  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.36 
 
 		 296 aa  328  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.67 
 
 		 296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.06 
 
 		 295 aa  325  7e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3578  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.72 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.674001 
 
 
-
 
NC_002950  PG1755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  51.55 
 
 		 293 aa  315  6e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  51.88 
 
 		 321 aa  315  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  52.72 
 
 		 301 aa  315  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  52.23 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  52.05 
 
 		 296 aa  311  6.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  51.89 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.64 
 
 		 296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.82 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.99 
 
 		 298 aa  298  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  26.71 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  26.71 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  27.81 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.43 
 
 		 355 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  27.78 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  26.99 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  27.78 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  28.44 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  25.83 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 		 359 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  25.08 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  30.16 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  27.78 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.1 
 
 		 355 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  27.37 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  26.26 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  26.21 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  28.09 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  26.88 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  26.8 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  25.93 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>