More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1485 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
262 aa  511  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.91 
 
 
269 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
272 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
271 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
276 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 
264 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.32 
 
 
275 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 
270 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 
271 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 
267 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
276 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
260 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
271 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 
275 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.28 
 
 
294 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 
270 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.28 
 
 
294 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.28 
 
 
294 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 
264 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
274 aa  145  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.57 
 
 
272 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 
270 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 
263 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.26 
 
 
279 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 
276 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 
273 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
271 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 
275 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 
270 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.19 
 
 
266 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.09 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
262 aa  139  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
270 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
257 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.2 
 
 
263 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 
270 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.57 
 
 
272 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.93 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.86 
 
 
264 aa  136  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.41 
 
 
281 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.47 
 
 
266 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.08 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.16 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.44 
 
 
268 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.26 
 
 
268 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.64 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10509  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.04 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  37.72 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2207  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.07 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.48 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.48 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  36.98 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.6 
 
 
272 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.19 
 
 
260 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.48 
 
 
272 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.85 
 
 
272 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  36.32 
 
 
262 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.1 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.83 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0075  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.74 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.57 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.11 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.51 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.37 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.19 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.51 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.85 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.19 
 
 
267 aa  125  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.82 
 
 
282 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.02 
 
 
272 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
271 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  34.7 
 
 
313 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  35 
 
 
266 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.82 
 
 
272 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
276 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.91 
 
 
267 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.95 
 
 
272 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.07 
 
 
260 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
272 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.07 
 
 
279 aa  122  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.7 
 
 
267 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.44 
 
 
274 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.73 
 
 
272 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  34.98 
 
 
262 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.97 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>