More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1144 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 137 aa  260  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  44.19 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  44 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  43.9 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  42.19 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2000  ferric uptake regulator, Fur family  46.83 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  35.2 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3564  ferric uptake regulator family protein  39.68 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.201475 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  33.6 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  38.17 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  37.1 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  34.68 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  36.89 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  32.79 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  34.43 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  31.93 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  32.8 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  32.8 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  32.8 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  33.07 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3626  ferric uptake regulator, Fur family  34.56 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  34.4 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.1 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  35.2 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  37.6 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  28.91 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  28.8 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.16 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  34.43 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  34.43 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  36 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  38.2 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  40.62 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  30.08 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  31.25 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  35.79 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  29.27 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  34.43 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  30.08 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  28.24 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  32.65 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  31.97 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  31.97 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  25.76 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  25.81 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  29.03 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  25.81 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  30.89 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  25.76 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  31.97 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  31.97 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  31.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  30.3 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  33.71 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  31.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  24.81 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  25.76 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  29.03 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  27.87 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  26.15 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  34.43 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  32.12 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  24.41 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>