35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0497 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0497  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  290  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.980208  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  46.55 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1677  hypothetical protein  41.35 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  34.03 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  30.51 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  38.89 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  34.15 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  28.46 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  34.45 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  33.86 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  29.31 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  29.31 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  30.63 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  27.42 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  32.76 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  35.65 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  28.8 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  26.09 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  32.17 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  31.09 
 
 		 187 aa  43.9  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  26.55 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  28.46 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  26.05 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  27.59 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  30.41 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  24.79 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  28.95 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2167  hypothetical protein  30.07 
 
 		 304 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.753723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  26.81 
 
 		 162 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  24.72 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  26.96 
 
 		 122 aa  40  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1451  hypothetical protein  29.1 
 
 		 277 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>