21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3404 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  99.4 
 
 		 1175 aa  2317    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  44.63 
 
 		 1140 aa  885    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  100 
 
 		 1175 aa  2331    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  39.52 
 
 		 1260 aa  707    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  39.52 
 
 		 1260 aa  707    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  33.28 
 
 		 1709 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  33.28 
 
 		 1402 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  32.82 
 
 		 1700 aa  532  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1222 aa  281  5e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1171 aa  274  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0660  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1171 aa  252  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  25.93 
 
 		 2118 aa  114  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  28.41 
 
 		 2000 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  28.06 
 
 		 1984 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1861  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1143 aa  95.9  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.701379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  30.19 
 
 		 2233 aa  94  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1702 aa  85.1  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  25 
 
 		 1757 aa  69.7  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  28.12 
 
 		 2434 aa  68.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  25.52 
 
 		 2418 aa  68.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1278 aa  60.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>