263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2808 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1147  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2808  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  100 
 
 
145 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  88.97 
 
 
145 aa  275  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2912  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.65 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3109  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  43.07 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412119  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3013  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.34 
 
 
141 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0058  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.14 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1053  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.04 
 
 
140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4363  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  46.1 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  43.61 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4581  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.84 
 
 
153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3716  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3196  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  42.86 
 
 
134 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0297  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.69 
 
 
137 aa  106  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2421  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.85 
 
 
146 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1127  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.14 
 
 
143 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0942  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.56 
 
 
144 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.583327  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2517  hypothetical protein  37.98 
 
 
138 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2618  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.56 
 
 
138 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0590  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.3 
 
 
141 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1778  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.35 
 
 
140 aa  100  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0250  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.08 
 
 
152 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0736  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.92 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2523  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.5 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.449226  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43799  predicted protein  34.75 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3882  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.77 
 
 
135 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1553  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.04 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4314  hypothetical protein  34.31 
 
 
162 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3641  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.57 
 
 
135 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.051183  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.71 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.1 
 
 
140 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0485  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.89 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231758  normal  0.0484471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1172  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.34 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.62 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959618  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1379  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.01 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.07 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.32 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.23 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.23 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.46 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.46 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0438  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.17 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0713  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.26 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2058  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.35 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0661  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.35 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0500  hypothetical protein  34.35 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2806  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.22176  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.26 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1688  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.08 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.82122 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1690  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.08 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165527  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1769  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.08 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.868913  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1588  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.08 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1751  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.08 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591601  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.04 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1569  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.06 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46941 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  39.24 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1392  hypothetical protein  37.72 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3578  hypothetical protein  32.5 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0728656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1659  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.59 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0879  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.16 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168693 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1928  hypothetical protein  35.96 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0849  hypothetical protein  35.96 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2062  hypothetical protein  35.96 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3234  hypothetical protein  35.96 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3220  hypothetical protein  35.96 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2681  hypothetical protein  35.96 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3181  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.96 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.01 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.3 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1412  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.27 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233929  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4770  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.61 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.251226  normal  0.268537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  34.17 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2604  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.03 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3022  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.87 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.48 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.86 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1907  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.46 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.39902  hitchhiker  0.0000265119 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2198  hypothetical protein  43.59 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.328863  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.91 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.58 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2174  hypothetical protein  31.62 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29150  hypothetical protein  35.54 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  34.48 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2665  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.23 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.97 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4001  hypothetical protein  29.23 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  42.31 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003386  hypothetical protein  39.29 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4371  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.96 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.732633  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2892  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  39.19 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.09 
 
 
136 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.33 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.09 
 
 
136 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.62 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.91 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.11 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  28.83 
 
 
136 aa  57.8  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1036  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.4 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4073  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.33 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>