More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2355 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  98.53 
 
 
407 aa  810    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  86.95 
 
 
407 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
407 aa  819    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  59.06 
 
 
405 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  52.45 
 
 
407 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  56 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  50.12 
 
 
413 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  53.88 
 
 
409 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  48.67 
 
 
420 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  49.38 
 
 
455 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  52.35 
 
 
413 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  49.03 
 
 
410 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  47.68 
 
 
453 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  48.09 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  47.58 
 
 
402 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  46.93 
 
 
428 aa  352  8e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  42.96 
 
 
407 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  44.12 
 
 
406 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  45.95 
 
 
415 aa  338  9e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  45.71 
 
 
411 aa  331  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  47.01 
 
 
408 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  44.67 
 
 
432 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  43.36 
 
 
406 aa  323  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  40.83 
 
 
402 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  47.84 
 
 
369 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  42.23 
 
 
406 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  45.29 
 
 
385 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  40.61 
 
 
405 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  43.9 
 
 
415 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  46.09 
 
 
425 aa  285  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  43.25 
 
 
460 aa  279  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  39.5 
 
 
423 aa  278  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  42.68 
 
 
412 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 
412 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 
518 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  39.85 
 
 
403 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
417 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  40.88 
 
 
437 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  42.33 
 
 
390 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  37.34 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  33.15 
 
 
401 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
406 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  26.63 
 
 
412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 
188 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 
188 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
402 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.43 
 
 
402 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
366 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
358 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  21.55 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
419 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  23.18 
 
 
364 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
416 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
539 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
401 aa  56.6  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  27.17 
 
 
363 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
446 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  23.49 
 
 
362 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
376 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.07 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
375 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
371 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1499  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
371 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.415023  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
536 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  29.59 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  30.41 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
389 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
387 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
413 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
402 aa  53.1  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
375 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
375 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
375 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
377 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>