25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1239 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  100 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  94.86 
 
 		 175 aa  335  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  74.05 
 
 		 175 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  60.51 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  52.26 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  51.32 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  47.47 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  50.66 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  50.99 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  51.66 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  45.89 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  45.21 
 
 		 195 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  43.15 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  39.1 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  35 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  41.5 
 
 		 198 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  34.84 
 
 		 191 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  33.13 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  33.13 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  35.62 
 
 		 200 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  36.36 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  34.44 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  26.32 
 
 		 380 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  29.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>