More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3056 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  67.4 
 
 		 504 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  87.6 
 
 		 512 aa  814    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  68.34 
 
 		 513 aa  648    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  66.13 
 
 		 500 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  87.4 
 
 		 512 aa  813    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 509 aa  1001    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  68.34 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  58.89 
 
 		 512 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  59.06 
 
 		 512 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  58.45 
 
 		 512 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  58.85 
 
 		 512 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  54.76 
 
 		 510 aa  531  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  57.83 
 
 		 502 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  58.65 
 
 		 512 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  58.28 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  57.85 
 
 		 512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  55.03 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  56.35 
 
 		 512 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  51.29 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  57.49 
 
 		 502 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  54.98 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  54.95 
 
 		 516 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  57.81 
 
 		 510 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  53.77 
 
 		 510 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  55.86 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  53.97 
 
 		 510 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  53.45 
 
 		 516 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  54.26 
 
 		 510 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  55.82 
 
 		 510 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  54.97 
 
 		 512 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  56.55 
 
 		 512 aa  485  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  59.04 
 
 		 506 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  53.19 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  53.42 
 
 		 532 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  55.53 
 
 		 512 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  55.69 
 
 		 509 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  54.28 
 
 		 512 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  45.71 
 
 		 502 aa  468  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  46.08 
 
 		 506 aa  466  9.999999999999999e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  54.47 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  45.27 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  51.87 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  47.71 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  45.83 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  47.16 
 
 		 520 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  49.9 
 
 		 499 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  44.73 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  44.73 
 
 		 512 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  42.26 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  46.61 
 
 		 508 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  47.9 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  42.38 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  45.24 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  49.28 
 
 		 485 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  42.97 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  46.72 
 
 		 513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  43.68 
 
 		 513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  42.91 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  45.82 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  44.16 
 
 		 513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  41.9 
 
 		 510 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  42.97 
 
 		 508 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  42.44 
 
 		 510 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  45.85 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  43.74 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  46.43 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  47.98 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  41.15 
 
 		 512 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 510 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  42.86 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  43.7 
 
 		 516 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  44.53 
 
 		 510 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  46.22 
 
 		 505 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  42.86 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  41.33 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  45.74 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  44.89 
 
 		 498 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  42.94 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  41.3 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  46.99 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  44.04 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  43.56 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  43.45 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  43.56 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  44.42 
 
 		 518 aa  388  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  44.04 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  43.73 
 
 		 518 aa  385  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  43.53 
 
 		 518 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  46.93 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  46.53 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  43.06 
 
 		 509 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  43.71 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  42.54 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  46.33 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  43.25 
 
 		 506 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  46.14 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  43.68 
 
 		 513 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  43.34 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  42.16 
 
 		 518 aa  382  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  44.05 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>