24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1942 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  351  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  73.14 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  72 
 
 		 175 aa  261  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  58.6 
 
 		 176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  49.68 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  48.1 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  49.34 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  52.63 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  49.01 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  44.52 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  44.14 
 
 		 195 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  42.47 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  39.74 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  38.1 
 
 		 198 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  34.68 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  33.77 
 
 		 186 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  33.55 
 
 		 191 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  35.4 
 
 		 200 aa  90.9  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  33.12 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  45.26 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  36.6 
 
 		 182 aa  84.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  27.63 
 
 		 380 aa  47.8  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>