34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3186 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  259  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  39.44 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  38.16 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  42.47 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  40.3 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.57 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  29.49 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.99 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  27.85 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.53 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  28.21 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  28.21 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  27.85 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  28.21 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.85 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  38.67 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  28.21 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  39.71 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  28.21 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  39.71 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  31.34 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  39.39 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  29.69 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  29.69 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  35.62 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  38.67 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  35.48 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  39.44 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.1 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  39.44 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  39.44 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3780  peptidase  34.25 
 
 		 248 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0669086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  39.44 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  28.99 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>