42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3138 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  795    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  32.03 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  32.31 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  32.27 
 
 		 403 aa  123  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  33.73 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  31.34 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  33.9 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  31.72 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  30.26 
 
 		 421 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  28.79 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  32.17 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  29.22 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  26.34 
 
 		 400 aa  96.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  29.08 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 399 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  29.1 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 		 399 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  27.27 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.67 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  29.56 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  29.56 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  28.37 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.86 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  27.78 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 625 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.83 
 
 		 676 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  33.71 
 
 		 634 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  31.05 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5759  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  23.57 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 		 376 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3118  hypothetical protein  34.87 
 
 		 494 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  30.46 
 
 		 631 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4292  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  23.21 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>