59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2939 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2939  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  31.86 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2576  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496816  normal  0.101525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  41.77 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 434 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 		 436 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1447  glycosyl transferase group 1  20.69 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000198609 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 768 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  31.62 
 
 		 434 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  33.9 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.58 
 
 		 427 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  42.35 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 423 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5803  hypothetical protein  24.67 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  39.68 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2609  glycosyl transferase, group 1  40.68 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  22.18 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  20.52 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  20.52 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 770 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 458 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.47 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 820 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  33.66 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 690 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  34.48 
 
 		 416 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4717  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 893 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.337059  normal  0.0164521 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  38.33 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.94 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  31.73 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 		 384 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  21.21 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 421 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.77 
 
 		 382 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  30.48 
 
 		 393 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 		 689 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  39.39 
 
 		 405 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.74 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>