45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1464 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 		 300 aa  590  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.28 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  28.81 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.36 
 
 		 340 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  26.28 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.62 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.14 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  30.38 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  29.54 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  30.61 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  29.24 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  34.52 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.51 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  27.31 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  22.22 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  22.67 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.07 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  28 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  30.59 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  25.65 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  34.34 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  32.4 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  31.45 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  26.12 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  33.58 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  32.07 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  30.38 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  60 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.86 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  51.85 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  54.35 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  53.19 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  32.26 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  31.03 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  33.67 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  36.54 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  31.82 
 
 		 326 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00190  hypothetical protein  29.05 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  29.63 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  47.83 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  51.11 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  32.26 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  26.75 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.63 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  29.71 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>