81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0334 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  99.71 
 
 		 339 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 339 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  80.12 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  57.76 
 
 		 327 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  57.56 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  52.37 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  52.37 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  52.07 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  52.06 
 
 		 340 aa  278  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.21 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  50 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  49.85 
 
 		 344 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.7 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  50.29 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  50.29 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  50.29 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  50.29 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  51.04 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  51.04 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  51.04 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.59 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  47.2 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.47 
 
 		 330 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  44.55 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.94 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.99 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.72 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  40.56 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.94 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.37 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.03 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40.73 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  41.37 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.15 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.76 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.98 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.82 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  36.53 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  52.63 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  34.93 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0868  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50.36 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0797  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.36 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  31.98 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  31.96 
 
 		 270 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.9 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.46 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.86 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.03 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  30.38 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.35 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  28.36 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.36 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.29 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.2 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.32 
 
 		 298 aa  96.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.55 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.55 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.43 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.25 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  27.98 
 
 		 285 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  27.08 
 
 		 281 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.59 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  28.46 
 
 		 295 aa  86.3  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.35 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  28.99 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  23.96 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  24.49 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  28.88 
 
 		 204 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  24.46 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.27 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.15 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  28.24 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.06 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.51 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  22.12 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  22.51 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.81 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4395  hypothetical protein  33.02 
 
 		 146 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.262018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.24 
 
 		 320 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2686  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.51 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000948216  normal  0.213043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>